La Decanatura de la Facultad de Medicina es la máxima dependencia de la Facultad.
Responde por la administración y buen funcionamiento de los programas curriculares que se impartan en la Facultad. Vela por el cumplimiento de los objetivos de los programas de investigación y extensión. Orienta las acciones de la Facultad promoviendo la integración de la docencia, la investigación, la extensión, la interdisciplinariedad y los altos niveles de calidad en las actividades misionales de la Universidad. Asegura el cumplimiento y ejecución de todas las normas, reglamentos, políticas y directrices en todas las materias de naturaleza académica, financiera y administrativa, trazadas por el Consejo Superior Universitario, el Consejo Académico, el Rector y demás autoridades de la Universidad.
El Decano. Es la autoridad responsable de la dirección académica y administrativa de la Facultad. Representa al Rector ante la misma y a la Facultad ante la Universidad.
El Decano es la autoridad responsable de la dirección académica y administrativa de las actividades de la Facultad de Medicina. Principalmente las relaciones del Decano con el medio Universitario contribuyen a la construcción de una organización adecuada y promueve el respeto en el trato entre los diferentes miembros de la comunidad de la Facultad.
El Decano es el representante de la Facultad ante las entidades externas, destaca la relación existente entre la Decanatura de la Facultad de Medicina y favorece la vinculación con las demás unidades de la Universidad.